中医反对喝咖啡主要与患者体质有关，由于咖啡因具有使神经中枢兴奋的作用，易引起人体亢奋，中医认为其具有温热之性，因此奉劝热性体质、心情烦躁、不易入睡的患者少喝咖啡。另外，正在服用中药或有胃部溃疡的患者，也要尽量少喝或不喝咖啡。
由于咖啡因需要经过烘焙，因此被中医普遍认为其属于温性。不同烘焙程度，中医认为有不一样的影响。浅焙咖啡较为温润，酸味较重，酸入肝有护肝、解肝毒的作用，对缓解短期的头痛、提振精神有一定效果。中、深焙咖啡偏燥热，易上火，如果味道偏苦，刺激过多可能会引起心悸、失眠、情绪焦躁。
另外，中医师们认为，本身是阴虚、湿热体质的人群，要少喝咖啡。因为中、深焙咖啡因的烘烤时间较长，比较燥热，阴虚体质的人群长期饮用这类咖啡的话容易出现上火、口干舌燥、便秘、眼睛酸涩的情况，还可能出现咖啡成瘾、秃头掉发的情况。
而湿热体质的人群过多饮用咖啡，可能会导致小便频繁，咖啡温热的性质也不利于治疗热性疾病。如果是胃阴虚夹湿热体质的人，在胃酸多的情况下喝咖啡会造成刺激，会导致胃食道逆流。因此建议严重热性体质，或是中重度以上肝经湿热、膀胱经湿热体质患者最好少喝咖啡。
注意：孕妇、青少年应少喝咖啡。若患者正在服用中药，需咨询医师是否能够饮用咖啡。此外，中医建议想要喝咖啡促进健康，可以选择咖啡因少、尽量不含人工添加物的黑咖啡。